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Traitement d'images sous ImageJ et les nouveaux logiciels FIJI et ICY : bases conceptuelles et pratiques (Gif-sur-Yvette)

RESPONSABLES

Cédric MATTHEWS

Ingénieur de recherche

UMR 7288

Christian ROUVIERE

Ingénieur de recherche

UMR 7009

Romain LE BARS

Ingénieur de recherche

UMR 9198

LIEU

GIF-SUR-YVETTE (91)

ORGANISATION

4 jours ; de 6 à 9 stagiaires

COÛT PÉDAGOGIQUE

1400 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires ; attestation de formation

DATE DU STAGE

17246 : du lundi 04/12/2017 au jeudi 07/12/2017

Janvier Février Mars Avril
Mai Juin Juillet Août
Sept. Oct. Nov. Déc.
17246

OBJECTIFS

- Acquérir, par une alternance de cours et de travaux pratiques, les concepts et les méthodes actuelles du traitement de l'image afin de conduire rapidement et automatiquement de façon autonome un travail complet d'analyse par les techniques de traitement de l'image
- Appréhender l'utilisation de nouveaux logiciels libres de droit comme FIJI et ICY et connaître les points forts et complémentaires de ces logiciels

PUBLIC

Chercheurs, ingénieurs et techniciens

PRÉREQUIS

Aucun

PROGRAMME

- Chaîne d'acquisition de l'image : des capteurs à l'image numérique
- Gestion des images à N-dimensions (stack et hyperstack, alignement de piles d'images), gestion de ROI, calibrage, mesures sur l'image
- Qualité de l'image : contraste, histogramme (normalisation et dilatation), dynamique, seuillage, correction de fond
- Amélioration de l'image : filtrage par convolution et filtres fréquentiels
- Analyse de l'image : morphologies mathématiques, segmentation, génération de masques, arithmétique de l'image, comptage d'objets en 2D
- Génération de macro, automatisation des processus de filtrage et de comptage d'objets par programmation graphique
- Représentation 3D, Tracking, co-localisation

La dernière demi-journée est consacrée à l'étude d'exemples apportés par les stagiaires (confidentialité garantie).

Voir programme détaillé téléchargeable ICI.

Alternance de cours (15 h) et de travaux pratiques et dirigés (15 h)

EQUIPEMENT

Un ordinateur sera mis à disposition de chaque stagiaire.

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