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Cryo-microscopie électronique : bases et nouveautés, les caméras à détection directe

Environnement scientifique et technique de la formation

Institut de biologie structurale - UMR 5075

RESPONSABLES

Guy SCHOEHN

Directeur de recherche

UMR 5075

Jean LEPAULT

Directeur de recherche

UMR 9198

LIEU

GRENOBLE (38)

ORGANISATION

2 jours
De 4 à 8 stagiaires
TP en sous-groupes de 3 - 4 personnes
Un intervenant et un microscope par sous-groupe

COÛT PÉDAGOGIQUE

1000 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

17253 : du jeudi 09/11/2017 au vendredi 10/11/2017

Janvier Février Mars Avril
Mai Juin Juillet Août
Sept. Oct. Nov.
17253
Déc.

OBJECTIFS

- Acquérir les bases théoriques et pratiques de la préparation des échantillons vitrifiés : films minces, congélation, transfert dans le microscope
- Connaître le principe d'imagerie dans des conditions de faible irradiation et s'initier à l'enregistrement d'images avec une caméra à détection directe
- Connaître les principes essentiels des méthodes de traitement d'images et les programmes disponibles

PUBLIC

Chercheurs, ingénieurs et techniciens désireux de s'initier à la cryo-microscopie électronique. Les chercheurs ayant un sujet adapté à la cryo-microscopie électronique et hésitant à aborder cette technique sont encouragés à participer à ce cours.

PRÉREQUIS

Connaissance des méthodes classiques de microscopie électronique

PROGRAMME

Cours (6 h). Ils seront composés de deux parties :
1/ Les bases nécessaires à l'enregistrement d'images de suspensions vitrifiées :
Formation des films minces de suspension - les cryo-microscopes - les différentes formes de glace - les dommages d'irradiation, enregistrement d'images en faible dose
2/ Les principes essentiels à l'analyse des images :
Correction de la fonction de transfert - optimisation du rapport signal sur bruit d'une image - classification des images - orientation des vues - reconstruction du volume de l'objet - estimation de la résolution - corrélation des résultats de cryo-microscopie à ceux obtenus par radiocristallographie

Travaux pratiques (7 h). Ils se feront sur les différents microscopes des plateformes de l'IBS. Pour analyser les avantages et inconvénients des différents microscopes, les stagiaires utiliseront au moins deux microscopes différents. Une analyse succincte des images sera faite.

Les TP seront réalisés préférentiellement sur des échantillons apportés par les stagiaires, sous réserve de l'accord du responsable scientifique et pédagogique du stage (contacter le responsable au plus tard une semaine avant le début de la formation pour définir les propriétés des échantillons apportés.)

EQUIPEMENTS

Polara 300 kV FEG (FEI) équipé d'une caméra K2 summit (Gatan)
Tecnai 200 kV FEG (FEI) équipé d'une caméra OneView (Gatan)
Tecnai 120 kV LaB6 (FEI) équipé d'une caméra Orius (Gatan)

INTERVENANTS

Chercheurs et ingénieurs des plateformes de microsocopie électronique de l'IBS

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