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Application du rayonnement synchrotron à l'étude structurale des protéines

Environnement scientifique et technique de la formation

Institut de biologie structurale - UMR 5075

RESPONSABLES

David COBESSI

Chargé de recherche

UMR 5075

Jean-Luc FERRER

Directeur de recherche

UMR 5075

LIEU

GRENOBLE (38)

ORGANISATION

2 jours
De 2 à 8 stagiaires
TP encadrés par un intervenant pour 4 stagiaires maximum

COÛT PÉDAGOGIQUE

800 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

17398 : du mercredi 20/09/2017 au jeudi 21/09/2017

Janvier Février Mars Avril
Mai Juin Juillet Août
Sept.
17398
Oct. Nov. Déc.

OBJECTIFS

- Savoir enregistrer des données de diffraction des rayons X sur des cristaux de protéines
- Connaître les principes du phasage MAD / SAD
- Etre capable d'effectuer une résolution de structure de protéine

PUBLIC

Techniciens, ingénieurs (Bac + 3 minimum)

PRÉREQUIS

Avoir suivi la formation " Etude structurale des protéines par cristallographie des rayons X " (Réf. 17192, ce catalogue) ou niveau équivalent

PROGRAMME

1er jour :
- Rayonnement synchrotron et applications - présentation de la ligne FIP-BM30A
- Enregistrement de données de diffraction sur FIP-BM30A : montage automatisé des échantillons et enregistrements in situ et à 100 K
- Enregistrement de données de diffraction anomale
- Traitement des données et initiation au phasage des données de diffraction anomale (MAD / SAD) - introduction à CCP4 et PHENIX

2ème jour :
- Construction du modèle protéique dans la carte de densité électronique calculée à partir des phases MAD / SAD
- Affinement de la structure - introduction aux logiciels CCP4 et PHENIX
- Visites des installations de l'ESRF, de l'IBS (dispositifs de purification et de cristallisation sous atmosphère contrôlée) et de l'ILL (dispositif de diffraction de neutrons : présentation de cette technique complémentaire pour l'analyse des protéines)
- Bilan : table ronde, échange entre les participants et les intervenants

Alternance de cours (30 %) et de travaux pratiques et dirigés (70 %)

EQUIPEMENT

Utilisation de la ligne FIP-BM30 de l'ESRF (European Synchrotron Radiation Facility)

INTERVENANTS

D. Cobessi, J-L Ferrer (chercheurs) et M. Pirochi (ingénieur)

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