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Analyse de modifications post-traductionnelles chez les bactéries

Environnement scientifique et technique de la formation

Polymères Biopolymères Surfaces - UMR 6270 Innovation chimie Carnot

RESPONSABLE

Julie HARDOUIN

Maître de conférences

UMR 6270

LIEU

MONT-SAINT-AIGNAN (76)

ORGANISATION

3 jours
De 4 à 6 stagiaires
TP encadrés par 2 intervenants

COÛT PÉDAGOGIQUE

1800 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

19239 : du mardi 18/06/2019 au jeudi 20/06/2019

Janvier Février Mars Avril
Mai Juin
19239
Juillet Août
Sept. Oct. Nov. Déc.

OBJECTIF

- Etre capable de mettre en oeuvre une stratégie d'étude des modifications post-traductionnelles (PTMs) chez une bactérie d'intérêt

PUBLIC

Chercheurs, ingénieurs, techniciens dans les secteurs pharmaceutique, microbiologique, santé, agroalimentaire, etc.

PRÉREQUIS

Connaissances de base en microbiologie et spectrométrie de masse

PROGRAMME

Chez les bactéries, les modifications post-traductionnelles (PTMs) ont été mises en évidence à la fin des années 70. Elles permettent à la bactérie de s'adapter rapidement aux différents stimuli extérieurs. De nombreuses PTMs jouent un rôle crucial dans les mécanismes d'adaptation, de résistance aux traitements, de virulence pour coloniser l'hôte. Leur caractérisation est donc devenue indispensable pour déterminer de nouveaux traitements antibiotiques.

1er jour
- Importance des modifications post-traductionnelles chez les bactéries (cours)
- Principes généraux en analyse protéomique (cours)
- Méthodologies / problématiques pour l'étude des PTMs chez les bactéries (cours)
- Préparation d'échantillons pour l'étude des PTMs (TP)
2ème jour
- Identification et quantification des PTMs (cours)
- Mise en pratique sur des spectromètres de masse couplés à de la nanochromatographie liquide (TP)
3ème jour
- Interprétation de données protéomiques pour caractériser les PTMs (TD)
- Que faire avec ces PTMs identifiées par analyse protéomique ? Quelles sont les méthodes émergentes dans le domaine ? (TD)

Alternance de cours (50 %) et de travaux dirigés et pratiques (50 %)

EQUIPEMENTS

Dispositifs d'électrophorèse mono- et bi-dimensionnelle, de chromatographie liquide et de spectrométrie de masse (haute résolution et haute précision).
Voir le site internet de la plateforme de protéomique PISSARO pour une description détaillée des équipements.

INTERVENANTS

J. Hardouin (maître de conférences) et P. Cosette (professeur)

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