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Métabolomique ciblée ou semi-ciblée par chromatographie et spectrométrie de masse

RESPONSABLE

Françoise GILARD

Ingénieure de recherche

UMR 9213

LIEU

ORSAY (91)

ORGANISATION

4 jours
De 4 à 8 stagiaires

COÛT PÉDAGOGIQUE

2000 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

20148 : du mardi 06/10/2020 au vendredi 09/10/2020

Janvier Février Mars Avril
Mai Juin Juillet Août
Sept. Oct.
20148
Nov. Déc.

OBJECTIFS

- S'initier aux techniques de la métabolomique
- Appréhender de manière pratique le dosage de métabolites ciblés par HPLC et LC-MS ainsi que le profilage semi-ciblé métabolique par GC-MS
- Être capable d'interpréter des données (chromatogrammes, spectres de masse, identification et quantification des métabolites)
- Être capable d'intégrer les résultats (analyse statistique)

PUBLIC

Chercheurs et ingénieurs en biologie ou biochimie

PRÉREQUIS

Niveau Bac + 5 en biologie, en biochimie ou en chimie

PROGRAMME

1er jour
- Initiation à la métabolomique : définition et fondements, techniques et contraintes, et exemples d'applications
- Préparation des échantillons : méthodes et exemples d'extraction à partir d'échantillons biologiques (atelier pratique)
2ème jour (par groupes de 4 personnes)
- Dosage de métabolites ciblés par HPLC et LC-MS : principe général et atelier pratique
3ème jour (par groupes de 4 personnes)
- Profilage métabolique par GC-MS : principe général et atelier pratique
- Initiation à la métabolomique par RMN
4ème jour
- Analyse statistique et intégration des données (TD)
- Apport de la fluxomique - Apports de la métabolomique : intérêts et futurs de la métabolomique
- Table ronde
Les stagiaires pourront suivre l'analyse d'une série d'échantillons biologiques de A à Z. Ils auront la possibilité d'apporter :
- un de leurs propres échantillons (végétal, animal, bactérie, culture de cellules...) pour une analyse test à des fins pédagogiques sous réserve de l'accord préalable du responsable scientifique
- un jeu de données (tableau de quantifications de métabolites) pour l'exploiter lors de l'atelier d'analyse statistique.

Alternance de cours (12 h) et de travaux pratiques et dirigés (15,5 h)

EQUIPEMENT

HPLC (Alliance Waters), LC-MS (Acquity Waters / MicrOTOF II Bruker Daltonics) et GC-MS (GC 7890 / MS 5977 Agilent)

INTERVENANTS

F. Gilard, F. Guerard, C. Mauve (ingénieurs) et B. Gakière (maître de conférences)

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