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La microscopie optique de fluorescence super-résolue : de la théorie à la pratique

Environnement scientifique et technique de la formation

Institut des sciences moléculaires d'Orsay

- UMR 8214
RESPONSABLES

Sandrine LEVEQUE-FORT

Directrice de recherche

UMR 8214

Guillaume DUPUIS

Maître de conférences

FR 2764

LIEU

ORSAY (91)

ORGANISATION

4 jours
De 6 à 12 stagiaires
TP en sous-groupes de 3 stagiaires maximum avec 1 intervenant par sous-groupe

COÛT PÉDAGOGIQUE

1500 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

20196 : du mardi 01/12/2020 au vendredi 04/12/2020

Janvier Février Mars Avril
Mai Juin Juillet Août
Sept. Oct. Nov. Déc.
20196
OBJECTIFS
-

Acquérir les bases théoriques en microscopie optique de fluorescence super-résolue


-

Comprendre la complémentarité entre les différentes approches de microscopie super-résolue (SMLM, STED, SIM)


-

Avoir les outils pour la préparation des échantillons pour la microscopie super-résolue


-

Être capable d'analyser les résultats à l'échelle nanométrique de manière critique


-

S'initier à ou approfondir l'utilisation pratique de différents microscopes super-résolus

PUBLICS
Chercheurs et ingénieurs
Afin d'adapter le contenu du stage aux attentes des stagiaires, un questionnaire téléchargeable ICI devra être complété et renvoyé au moment de l'inscription.
Prérequis : avoir une expérience en microscopie de fluorescence. Avoir suivi un des stages "Atelier de microscopie confocale" (Réf. 20182 ou "La microscopie de fluorescence : bases et nouveautés" (Réf. 20180, ce catalogue) ou niveau équivalent
PROGRAMME
Cours (50 % du temps, le matin)
- Rappels des bases en microscopie de fluorescence classique et ses limites associées
- Microscopie de localisation de molécules uniques (SMLM : dSTORM, PALM...)
- Microscopie STED
- Microscopie sous illumination structurée (SIM)
- Préparation des échantillons
- Nouvelles stratégies de marquage
- Traitement des données et des images
Travaux pratiques (50 % du temps, les après-midis) : principales approches de la super-résolution (SMLM, SIM, STED)
Pour chaque technique :
. prise en main de l'instrument, procédures de réglage et d'alignement, mesure des performances sur des échantillons calibrés (2 h)
. approfondissement : retour sur les acquis de la veille, observation d'échantillons biologiques, démarche méthodologique à suivre pour des problématiques de co-localisation, analyse des données et des images acquises (2 h). L'accent sera mis sur les bénéfices et les limites de chaque technique.
- Observation des échantillons des stagiaires (à des fins pédagogiques avec l'accord préalable du responsable de la formation) sur les instruments de leur choix (2 h)
- Echanges dans le cadre d'une table ronde (2 h) sur leurs problématiques et les approches méthodologiques à mettre en œuvre pour utiliser au mieux les techniques de super-résolution en fonction des échantillons apportés par les stagiaires
EQUIPEMENTS
Microscope dSTORM/PALM, microscope STED, microscope SIM
Voir le site internet de l'ISMO pour une description détaillée des équipements
INTERVENANTS
S. Lévêque-Fort (chercheuse), G. Dupuis, A. Fragola (maitres de conférences) et intervenants extérieurs
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