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Cytométrie avancée et standardisation

Environnement scientifique et technique de la formation

Centre de physiopathologie de Toulouse Purpan - UMR 5282

RESPONSABLES

Fatima L'FAQIHI-OLIVE

Ingénieure de recherche

UMR 5282

Alexia ZAKAROFF-GIRARD

Ingénieure d'études

UMR 1048

LIEU

TOULOUSE (31)

ORGANISATION

2 jours
De 5 à 10 stagiaires
TD et TP en sous-groupes de 5 stagiaires maximum encadrés par deux intervenantes

COÛT PÉDAGOGIQUE

900 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

20210 : du lundi 28/09/2020 au mardi 29/09/2020

Janvier Février Mars Avril
Mai Juin Juillet Août
Sept.
20210
Oct. Nov. Déc.

OBJECTIFS

- Maîtriser les principes généraux de construction d'un panel en cytométrie
- Maîtriser les paramètres pour un bon réglage machine
- Être capable de standardiser une expérience de cytométrie entre deux ou plusieurs cytomètres
- Être capable de standardiser une expérience de cytométrie au cours du temps sur un même cytomètre

PUBLICS

Chercheurs, ingénieurs, techniciens exerçant dans le domaine des sciences du vivant
Afin d'adapter le contenu du stage aux attentes des stagiaires, un questionnaire téléchargeable ICI devra être complété et renvoyé au moment de l'inscription.

PRÉREQUIS

Connaissances et pratique de base sur l'analyse par cytométrie en flux multicouleur. Utilisation du logiciel d'acquisition DIVA. Avoir suivi un stage classique de cytométrie (Réf. 20200, 20201, 20202, 20203, 20211, ce catalogue) ou niveau équivalent

PROGRAMME

Cours théorique et travaux dirigés
- Cytométrie avancée (3 h) :
. rappels théoriques (45 min) : comment faire un bon réglage pour une analyse multicouleur ? Les contrôles, les compensations
. comment choisir les fluorochromes et construire un panel ?
. impact sur la compensation, sur l'étalement des données (spread data) et sur les résultats
- Standardisation (3 h) :
. pourquoi, quand, quel intérêt ?
. linéarité des signaux, bruit de fond électronique
. contrôle qualité et suivi des cytomètres
. standardisation d'une expérience au cours du temps
. standardisation inter-machines
Travaux pratiques
- Contrôles qualité de l'appareil
. contrôle qualité automatique de l'instrument : ligne de base, contrôle des performances de l'appareil
. contrôle qualité manuel : billes 8 pics
- Applications avancées du logiciel DIVA :
. réglages / acquisitions de données et sauvegarde : compensations automatiques sur différents types d'échantillons, vue d'ensemble de l'expérience, catalogue et modèles
. représentation et analyses de données : page d'acquisition et d'analyse, superposition des graphes (Overlay), statistiques, analyses groupées (Batch analysis)
- Marquage 6 couleurs analysé et standardisé sur deux appareils différents
- Méthode de standardisation manuelle pour comparer des expériences au cours du temps
- Méthode de standardisation automatique avec le logiciel DIVA : application settings
Alternance de cours (6 h) de travaux dirigés et pratiques (6 h)

EQUIPEMENT

Cytomètre BD LSR II, cytomètre BD LSR Fortessa, logiciel DIVA

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