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La cytométrie en flux appliquée à la microbiologie

RESPONSABLE

Julie CAZARETH

Ingénieure d'études

UMR 7275

LIEU

VALBONNE (06)

ORGANISATION

2,5 jours
De 8 à 10 stagiaires
TP en sous-groupes de 5 stagiaires maximum avec un intervenant par sous-groupe

COÛT PÉDAGOGIQUE

1000 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

20211 : du mercredi 01/04/2020 au vendredi 03/04/2020

Janvier Février Mars Avril
20211
Mai Juin Juillet Août
Sept. Oct. Nov. Déc.

OBJECTIFS

- Acquérir par une alternance de théorie et de pratique la méthodologie d'analyse de micro-organismes par cytométrie en flux
- Savoir optimiser les réglages du cytomètre
- Connaître les contraintes liées à l'analyse des micro-organismes
- Être capable d'adapter son protocole de préparation de l'échantillon en fonction de l'application

PUBLICS

Chercheurs, techniciens et ingénieurs du secteur agro-alimentaire ou de tout laboratoire étudiant les microorganismes (hors biologie marine et médicale)

Afin d'adapter le contenu du stage aux attentes des stagiaires, un questionnaire téléchargeable ICI devra être complété et renvoyé au moment de l'inscription.

PRÉREQUIS

Aucun prérequis en cytométrie en flux : cette formation est destinée aux débutants en cytométrie, mais nécessite des connaissances de base en microbiologie

PROGRAMME

Cours (8 h)
- Principe de la cytométrie
- Contraintes et intérêts de la cytométrie en microbiologie
- Dénombrement (viabilité) des micro-organismes
- Détection spécifique (FISH, Ac, GFP)
- Physiologie et fonctionnalités microbiennes : vitalité, potentiel de membrane, pH intracellualire, fluidité membranaire

Démonstration pratique et travaux dirigés (6 h)
- Préparation de l'échantillon (jus de fruit, produits laitiers)
- Réglages du cytomètre (gain et compensation, seuils)
- Dénombrements (flore totale, bactéries, levures)
- Détection spécifique (FISH)
- Cinétique de vitalité sur une bactérie ou une levure
- Potentiel de membrane, pH intracellulaire
- Analyse et interprétation des données

EQUIPEMENT

Cytomètre Cube de Sysmex

INTERVENANTS

J. Cazareth (ingénieure d'études) et M. Bouix (professeure)

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