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Atelier de microscopie confocale

Environnement scientifique et technique de la formation

Institut de biologie intégrative de la cellule - UMR 9198

RESPONSABLES

Romain LE BARS

Ingénieur de recherche

UMR 9198

Laetitia BESSE

Ingénieure d'études

UMR 9198

Sandrine LECART

Ingénieure de recherche

UMR 9198

LIEU

GIF-SUR-YVETTE (91)

ORGANISATION

5 jours ; 20 stagiaires maximum

COÛT PÉDAGOGIQUE

1600 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires ; attestation de formation

DATE DU STAGE

18129 : du lundi 15/10/2018 au vendredi 19/10/2018

Janvier Février Mars Avril
Mai Juin Juillet Août
Sept. Oct.
18129
Nov. Déc.

OBJECTIFS

- Acquérir et renforcer les bases théoriques de la microscopie photonique
- Approfondir et maîtriser l'utilisation pratique d'un microscope plein champ et confocal
- Intégrer les principes et possibilités des nouvelles applications et développements en microscopie photonique
- Comprendre les complémentarités des techniques de la microscopie conventionnelle à la super-résolution

PUBLIC

Chercheurs, ingénieurs, techniciens

PRÉREQUIS

Une expérience en microscopie photonique est essentielle.

PROGRAMME

Cours (50 % du temps)
- Rappels de microscopie conventionnelle, vidéomicroscopie
- Introduction à la microscopie confocale (physique de l'instrument, acquisition, numérisation, échantillonnage, multiples marquages)
- Microscope confocal rapide à disque de Nipkow (Spinning disk)
- Mieux comprendre et utiliser les fluorochromes en microscopie confocale, protéines et sondes fluorescentes
- Préparation des échantillons biologiques vivants et fixés
- Traitement et utilisation d'images 2D et 3D appliquées à la microscopie
- Applications particulières en microscopie confocale, FLIM, FRAP, photoactivation, FRET, FCS, etc.
- Approches complémentaires : excitation biphotonique et optique non linéaire, techniques de super-résolution (PALM, STORM, STED, SIM)
- Séminaires d'application
TP en sous-groupes de 5 personnes maximum avec un intervenant par sous-groupe (50 % du temps)
Un cycle de dix travaux pratiques sur vingt heures permettra de renforcer le lien entre théorie et applications, de reconnaître les éléments mis en œuvre, d'acquérir des images, de les traiter et de les analyser avec ImageJ notamment.
Une séance pratique d'acquisition d'images peut être programmée sur les échantillons apportés par les stagiaires à des fins pédagogiques. "Happy Hour", le mardi à 18h15 (facultatif)

EQUIPEMENTS

Microscopes : Leica SP8 et SP8X, Zeiss LSM 880, Spinning-Disk Roper, Nikon N-STORM
Logiciels : MetaMorph, ImageJ, Huygens déconvolution

INTERVENANTS

Membres de la plateforme Photonique Imagerie Gif et une dizaine d'intervenants extérieurs.

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