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Métabolomique ciblée ou semi-ciblée par chromatographie et spectrométrie de masse

RESPONSABLE

Françoise GILARD

Ingénieure de recherche

UMR 9213

LIEU

ORSAY (91)

ORGANISATION

4 jours
De 4 à 8 stagiaires

COÛT PÉDAGOGIQUE

1800 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

18229 : du mardi 05/06/2018 au vendredi 08/06/2018

Janvier Février Mars Avril
Mai Juin
18229
Juillet Août
Sept. Oct. Nov. Déc.

OBJECTIFS

- S'initier aux techniques de la métabolomique
- Appréhender de manière pratique le dosage de métabolites ciblés par LC-MS ainsi que le profilage semi-ciblé métabolique par GC-MS
- Etre capable d'interpréter des données (chromatogrammes, spectres de masse, identification et quantification des métabolites)
- Etre capable d'intégrer les résultats (analyse statistique)

PUBLIC

Chercheurs et ingénieurs en biologie ou biochimie

PRÉREQUIS

Niveau Bac + 5 en biologie ou en chimie

PROGRAMME

1er jour
- Initiation à la métabolomique : définition et fondements, techniques et contraintes et exemples d'applications
- Préparation des échantillons : méthodes et exemple d'extraction à partir d'échantillons biologiques (atelier pratique)
2ème jour (par groupes de 4 personnes)
- Dosage de métabolites ciblés par LC-MS : principe général et atelier pratique
3ème jour (par groupes de 4 personnes)
- Profilage métabolique par GC-MS : principe général et atelier pratique
- Initiation à la métabolomique par RMN
4ème jour
- Analyse statistique et intégration des données (TD)
- Apport de la fluxomique - Apports de la métabolomique : intérêts et futurs de la métabolomique
- Table ronde
Les stagiaires pourront suivre l'analyse d'une série d'échantillons biologiques de A à Z. Ils auront la possibilité d'apporter :
- un de leurs propres échantillons (végétal, animal, bactérie, culture de cellules...) pour une analyse test à des fins pédagogiques sous réserve de l'accord préalable du responsable scientifique.
- un jeu de données (tableau de quantifications de métabolites) pour l'exploiter lors de l'atelier d'analyse statistique.


Alternance de cours (12 h) et de travaux pratiques et dirigés (15,5 h)

EQUIPEMENT

LC-MS (Acquity Waters / MicrOTOF II Bruker Daltonics) et GC-MS (GC 7890 / MS 5977 Agilent)

INTERVENANTS

F. Gilard, F. Guerard, C. Mauve (ingénieurs) et B. Gakière (maître de conférences)

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