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Spectrométrie de masse pour l'analyse de molécules biologiques

Environnement scientifique et technique de la formation

Laboratoire de chimie physique

- UMR 8000
RESPONSABLE

Frédéric HALGAND

Chargé de Recherche

UMR 8000

LIEU

ORSAY (91)

ORGANISATION

4 jours
De 4 à 9 stagiaires
TP en sous-groupes de 3 stagiaires

COÛT PÉDAGOGIQUE

2000 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

20150 : du lundi 11/05/2020 au jeudi 14/05/2020

Janvier Février Mars Avril
Mai
20150
Juin Juillet Août
Sept. Oct. Nov. Déc.
OBJECTIF
-

Être capable d'analyser des biomolécules, notamment en prenant en compte les spécificités applicables aux grandes classes de molécules (protéines et peptides, oligosaccharides, métabolites, molécules structurales)

PUBLICS
Techniciens, ingénieurs et chercheurs utilisateurs ou futurs utilisateurs de la spectrométrie de masse (MS) pour l'analyse de biomolécules
Afin d'adapter le contenu du stage aux attentes des stagiaires, un questionnaire téléchargeable ICI devra être complété et renvoyé au moment de l'inscription.
Prérequis : connaissances générales sur la MS (niveau Bac + 4 minimum)
PROGRAMME
1er jour
- Rappel des bases de la spectrométrie de masse : mesure de masse, diversité de l'instrumentation, principaux analyseurs, choix d'une instrumentation adaptée
- Sources d'ionisation pour l'analyse de biomolécules : ESI, APCI, MALDI
- Analyse de peptides par spectrométrie de masse
TP : analyse de peptides et protéines sur un instrument de type Q-TOF
2ème jour
- Préparation des échantillons : précautions et généralités. NB : cet aspect du programme fera l'objet d'une journée de formation dédiée (Réf. 20169, ce catalogue)
- Analyse de métabolites par spectrométrie de masse : approches ciblées ou globales (métabolomique)
TP : analyse de métabolites par GC-MS
3ème jour
- Principes guidant la fragmentation des molécules biologiques : modèle du proton mobile et application à la fragmentation des peptides, oligosaccharides et oligonucléotides
- Imagerie moléculaire de biomolécules
- Analyse d'oligosaccharides par spectrométrie de masse
- Analyse de protéines par spectrométrie de masse : étude de complexes en conditions natives, séquençage par approches top-down
4ème jour
- Mobilité ionique couplée à la spectrométrie de masse
- Approches quantitatives et analyses statistiques des données de spectrométrie de masse
TP : séquençage de peptides
- Table-ronde et bilan avec les participants
Alternance de cours et exemples d'application (15,5 h) et de TP (10,5 h)

Ce stage peut-être poursuivi par une journée de formation (le vendredi) : "Préparation des échantillons pour l'analyse de protéines et de peptides par spectrométrie de masse" (Réf. 20169, ce catalogue)
INTERVENANTS
G. van der Rest, (professeur), D. Touboul, J.-Y. Salpin, F. Halgand, V. Redeker, W. Bienvenut (chercheurs) et F. Gilard (ingénieur)
Stage organisé en partenariat avec le service de formation continue de la faculté des sciences d'Orsay de l'Université Paris-Sud
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