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Cytométrie en image

Environnement scientifique et technique de la formation

Biosciences - UMS 3444 Centre de physiopathologie de Toulouse Purpan - UMR 5282

RESPONSABLES

Sébastien DUSSURGEY

Assistant Ingénieur

UMS 3444

Valére DUPLAN-ECHE

Ingénieure d'études

UMR 5282

LIEU

LYON (69)

ORGANISATION

3 jours
De 4 à 10 stagiaires
TP et TD encadrés par un intervenant pour 5 stagiaires maximum

COÛT PÉDAGOGIQUE

1300 Euros

A L'ISSUE DE LA FORMATION

Evaluation de la formation par les stagiaires
Envoi d'une attestation de formation

DATE DU STAGE

20209 : du mercredi 18/11/2020 au vendredi 20/11/2020

Janvier Février Mars Avril
Mai Juin Juillet Août
Sept. Oct. Nov.
20209
Déc.

OBJECTIFS

- Découvrir les applications en lien avec la technologie de cytométrie en image, ses avantages et ses limites
- Acquérir des bases théoriques et pratiques de la cytométrie en image
- S'initier au logiciel d'analyse pour le traitement des données

PUBLICS

Techniciens, ingénieurs, chercheurs

Afin d'adapter le contenu du stage aux attentes des stagiaires, un questionnaire téléchargeable ICI devra être complété et renvoyé au moment de l'inscription.

PRÉREQUIS

Connaissances de base en cytométrie conventionnelle ou en imagerie photonique. Avoir suivi un des stages d'introduction à la cytométrie (Ref. 20200, 20201, 20202, 20203, 20211, ce catalogue) ou de microscopie photonique (Réf. 20180 ou 20182, ce catalogue) ou niveau équivalent

PROGRAMME

- Introduction à la technologie de la cytométrie en image (cours) :
. principe de la cytométrie en image
. présentation des applications courantes et émergentes
- Conception d'une expérience de cytométrie en image (TD) :
. préparation des échantillons
. création d'un panel multicouleurs
. importance et choix des contrôles
. exercices autour de la préparation d'une expérience
- Acquisition d'échantillons sur un cytomètre en image (TP) :
. présentation de l'appareil
. présentation du logiciel d'acquisition INSPIRE
. acquisition des échantillons
. paramétrage de l'expérience
- Analyse des données : présentation du logiciel IDEAS, compensations, traitement d'images, création de graphes... (TD)
- Analyse des données : création de masques, de paramètres (TD)
- Exercices divers sur le traitement des données (TD) :
. analyse de translocation nucléaire
. analyse du flux autophagique

Les stagiaires sont invités à apporter un échantillon qui pourra être étudié à des fins pédagogiques sous réserve de l'accord préalable du responsable de la formation.


Alternance de cours (4 h), de travaux dirigés (11,5 h) et de travaux pratiques (2,5 h)

EQUIPEMENT

Cytomètre en image (ImageStreamX, Merck)

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