Microscopies photonique et électronique, cytométrie et analyse des données : bases théoriques, applicatives et pratiques Présentiel

Cours (50 % du temps)

Le cours insistera sur les connaissances de base requises pour comprendre les différentes techniques et les applications possibles.

• La cytométrie: principe, composants d'un cytomètre, la fluorescence et la cytométrie
• Applications cytométrie: cycle cellulaire, apoptose, phénotypage, interaction cellulaire cyto en image, dosage de cytokines, sondes métabolique, tri cellulaire
• La microscopie : Les différents types de microscopie photonique : fond clair, contraste de phase, fluorescence...
• La microscopie de fluorescence : marquage, biosenseurs et applications
• L'échantillon sous le microscope : interaction lumière / échantillon et préparation d'échantillon
• Les différents types de microscopes de fluorescence : performances, avantages et inconvénients
• Présentation des méthodes pour la préparation d'échantillons en microscopie électronique en transmission
• Comprendre les principes de base des microscopes électroniques à transmission
• Principe des microscopes électronique à balayage
• Préparation des échantillons en MEB
• Généralités sur l'analyse de données
• Application à l'analyse d'images

Travaux pratiques (50 % du temps)

Travaux pratiques en petits groupes sur différents appareillages de la plateforme TRI toulousaine (microscopes, cytomètres, stations d'analyse…)

• Avantages et limites des différents systèmes

• Acquérir des bases théoriques sur les techniques
• Connaitre les applications possibles pour chaque technologie
• Aborder l'aspect pratique de ces méthodes

Microscopes champ large, microscopes confocaux, microscopes multi-photons, microscope à feuille de lumière, cytomètres analyseur, trieurs, cytomètre en image, microscopes électroniques à transmission, microscopes électroniques à balayage.

Si possible, les participants devront amener un PC et installer certains logiciels.

Ressources pédagogiques : supports papier et dématérialisés.