Microscopie de super-résolution basée sur la détection de molécules individuelles (SMLM) Présentiel

À l'issue de la formation, les participants connaitront les bases théoriques de la microscopie de super-résolution basée sur la détection de molécules individuelles. Ils sauront choisir la technique adaptée à leur besoin et seront capables de concevoir et de mettre en œuvre une expérience de microscopie SMLM. Les participants seront aussi capables de reconstruire et de produire une analyse quantitative des données obtenues en SMLM.

Jour 1 :

• Introduction to single-molecule localization microscopy (SMLM) (60 min) Magali Mondin

Pause / Questions

• Image reconstruction of single-molecule localization microscopy data (60 min) Jean-Baptiste Sibarita

Jour 2 : 

• Sample preparation: overview of fluorochromes and labeling strategies (45 min) Matthieu Sainlos

Pause / Questions

• Challenges and solution to perform single molecule localization microscopy in depth within complex tissues (45 min) Rémi Galland

Pause / Questions

• Analysis of single-molecule localization microscopy data (45 min) Florian Levet

Déjeuner

• Practical session # 1 (2h) STORM 2D / PAINT 3D / Image reconstruction SMLM / SPT / Analyse SPT
• Practical session # 2 (2h) STORM 2D / PAINT 3D / Image reconstruction SMLM / SPT / Analyse SPT

Jour 3 : 

• Practical session # 3 (2h) STORM 2D / PAINT 3D / Image reconstruction SMLM / SPT / Analyse SPT
• Practical session # 4 (2h) STORM 2D / PAINT 3D / Image reconstruction SMLM / SPT / Analyse SPT

• Acquérir les principes des différentes techniques de SMLM
• Appréhender les avantages / inconvénients des différentes techniques de SMLM
• Identifier la technique la mieux appropriée à une application biologique
• Mettre en œuvre (préparation d'échantillons, acquisition des données) une expérience de DNA-PAINT de dSTORM ou de sptPALM
• Analyser et traiter des données de SMLM avec des logiciels gratuits 

Sessions pratiques à la carte : Chaque participant pourra suivre 4 sessions pratiques parmi un choix de 5 propositions. Les roulements et répétitions de chaque TP seront organisés à la clôture des inscriptions en fonction des choix des participants (Cf questionnaire préalable)

TP SMLM 1 = Microscopie DNA-PAINT 3D sur système développé maison

TP SMLM 2 = Microscopie STORM 2D multi-couleur sur système commercial

TP SMLM 3 = Reconstruction et traitement des images de localisation

TP SMLM 4 = Microscopie de suivi de molécules individuelles (single particle tracking)

TP SMLM 5 = Analyse des données de suivi de molécules individuelles (single particle tracking)